当儿子从妈妈那里得到X染色体的时候，妈妈编译大脑的时候用的X染色体是被随机选择过的，母子俩的大脑结构可能完全不一样，也可能有很大的相似程度，最有可能的结果是既有一部分的相似度，又有一部分的不同。大自然的设计就是如此巧妙，尽管妈妈在儿子智力遗传问题上要负主要责任，但是仅凭妈妈的聪明程度还是不能绝对准确地预测儿子智力水平的高低。

　　另外，由于基因印记①(Genomicimprinting)的存在，有科学家猜测相对于妈妈通过X染色体遗传智力，爸爸是通过常染色体②表达基因从而影响后代的大脑和行为的。但由于基因印记很少见，只占不足1%，这种影响并不显著。